Polskie LNG było spółką- córką operatora gazociągów przesyłowych Gaz-System. Uchwałą z 26 lutego 2016 r. rada nadzorcza Polskiego LNG S.A. zmieniła strukturę organizacyjną spółki zależnej i zlikwidowała dwie jednostki organizacyjne: Biuro Komunikacji Korporacyjnej oraz Biuro Strategii i Analiz. W wyniku tej decyzji kompetencje związane z komunikacją oraz ze strategią i rozwojem terminalu LNG przeszły do Gaz-System S.A., który jest właścicielem Polskiego LNG S.A.
- Terminal LNG jest integralną częścią krajowego systemu przesyłowego zarządzanego przez Gaz-System S.A. i jego rozwój musi być spójny z innymi działaniami rozwojowymi operatora gazociągów przesyłowych - wyjaśnia powód tych zmian Gaz-System S.A.- Priorytetem dla Polskiego LNG S.A. jest obecnie dokończenie projektu, uzyskanie pozwolenia na użytkowanie i przygotowanie służb technicznych terminalu LNG do jego bezpiecznej eksploatacji oraz wdrożenie procedur eksploatacyjnych zgodnych ze standardami obowiązującymi w Gaz-System S.A.
Niedawno zmieniły się władze Gaz-Systemu. Dotychczasowego prezesa Jana Chadama zastąpił Tomasz Stępień. Chadam pozostał jednak prezesem Polskiego LNG. Po wchłonięciu spółki córki zniknie jego stanowisko.