Komandor Krzysztof ZDONEK jest absolwentem Akademii Marynarki Wojennej w Gdyni z 1988 roku. W tej samej uczelni w latach 2001-2002 studiował na podyplomowych studiach dowódczo – sztabowych na kierunku „Dowodzenie i kierowanie siłami morskimi”. W latach 1998 - 1999 ukończył studia sztabowe w Akademii Sztabowej Marynarki Wojennej USA w Newport (Stany Zjednoczone). Następnie w latach 2013 - 2014, ponownie studiował w Newport, na Podyplomowych Studiach Polityki Obronnej w Akademii Dowódczej Marynarki Wojennej Stanów Zjednoczonych (United States Naval Command College).

Służbę wojskową po ukończeniu Akademii Marynarki Wojennej rozpoczął na stanowisku zastępcy dowódcy okrętu w 2. Brygadzie Okrętów Desantowych w Świnoujściu. W 1995 roku został wyznaczony na stanowisko dowódcy okrętu ORP „GNIEZNO”.

W roku 2002 objął stanowisko szefa sztabu – zastępcy dowódcy 12. Dywizjonu Trałowców w Świnoujściu. Pełniąc obowiązki na wymienionych stanowiskach wielokrotnie uczestniczył w ćwiczeniach i operacjach międzynarodowych, miedzy innymi w 1993 roku uczestniczył w pierwszych ćwiczeniach morskich w ramach programu Partnerstwo dla Pokoju pk.: BALTIC ENDEAVOUR, a w 1996 jako oficer sztabu Komponentu Morskiego w ćwiczeniach pk.: COOPERATIVE VENTURE (na pokładzie okrętu holenderskiego). W roku 1997 pełnił służbę w Polsko – Amerykańskiej Misji Łącznikowej przy Departamencie Wojskowych Spraw Zagranicznych MON, komórce koordynującej wspólne polsko-amerykańskie przedsięwzięcia szkoleniowe. W 2002 uczestniczył jako szef sztabu zespołu (na pokładzie niemieckiego okrętu dowodzenia) w operacji niszczenia min morskich pk.: OPEN SPIRIT. W 2005 dowodził ćwiczeniem BALTICA (trójstronne ćwiczenie sił obrony przeciwminowej w ramach Trójkąta Weimarskiego). W roku 2005 został wyznaczony na stanowisko dowódcy 2. Dywizjonu Okrętów Transportowo – Minowych. W 2007 roku w uznaniu zasług w szkoleniu i służbie Prezydent RP Lech Kaczyński wyróżnił dowodzony przez komandora dywizjon Flagą RP, a w 2008 roku za szczególne zasługi w dowodzeniu oraz szkoleniu sił obrony przeciwminowej w Marynarce Wojennej, Minister Obrony Narodowej wyraził oficerowi uznanie w formie wpisu do „Księgi Honorowej Ministra Obrony Narodowej”. Dowodzony przez niego dywizjon w 2009 roku uzyskał najwyższą w Wojsku Polskim ocenę z kontroli kompleksowej (bardzo dobrą) i został uhonorowany za szczególne osiągnięcia w wykonywaniu zadań służbowych Znakiem Honorowym Sił Zbrojnych RP. W 2009 kmdr Krzysztof ZDONEK objął stanowisko szefa szkolenia 8. Flotylli Obrony Wybrzeża. W trakcie sprawowania tej funkcji był bezpośrednio odpowiedzialny za proces przygotowania i wydzielenia (po raz pierwszy w Marynarce Wojennej) okrętu dowodzenia i polskiego sztabu do Stałego Zespołu Sił Obrony Przeciwminowej NATO – SNMCMG 1.

Przygotowanie oraz działalność wydzielonych sił zostały bardzo wysoko ocenione przez dowództwo Komponentu Morskiego NATO (MCC Northwood). W 2012 roku został wyznaczony na stanowisko zastępcy dowódcy 8.FOW. Na wszystkich zajmowanych stanowiskach osiągał znaczące sukcesy w dowodzeniu i szkoleniu, co potwierdzały inspekcje, sprawdziany, kontrole i nadzory służbowe prowadzone przez przełożonych i inne uprawnione instytucje wojskowe. W 2014 roku po ukończeniu studiów polityki obronnej w Naval Command College został wyznaczony na stanowisko szefa Oddziału Ćwiczeń w Zarządzie Morskim Inspektoratu Marynarki Wojennej Dowództwa Generalnego RSZ, a w listopadzie tego samego roku objął stanowisko służbowe Szefa Zarządu Uzbrojenia w Inspektoracie Marynarki Wojennej w Dowództwie Generalnym Rodzajów Sił Zbrojnych.

Komandor Krzysztof ZDONEK od 6 maja 2016 roku dowodzi 8. Flotyllą Obrony Wybrzeża.

kmdr ppor. Jacek Kwiatkowski